Методическую работу института координирует методический совет, действующий на основании «Положения о методическом совете». В его состав входят зам директора по учебной работе, учебно- производственной работе, воспитательной работе, начальник вычислительного центра, методист, руководитель физического воспитания и все председатели цикловых комиссий. Методический совет работает в соответствии с планом, составленным на учебный год. На его заседаниях рассматриваются: вопросы планирования работы, организации и проведения различных методических мероприятий (семинаров, педагогических чтений, конференций, смотров-конкурсов и т.д.),  внедрения в учебный процесс современных педагогических технологий, повышения роли производственной практики в подготовке специалистов, работа заочного отделения и т.д.

Большое внимание в институте уделяется повышению квалификации преподавателей, их методическому и педагогическому мастерству. Ежегодно 15-18 работников института повышают свою квалификацию при УМЦ по образованию на ж.д. транспорте г. Москва, при  БГПУ  (ФППК) г. Благовещенска и УМЦ ЖДТ г. Хабаровска. Кроме этого, преподаватели спецдисциплин по графику проходят стажировку на линейных предприятиях Тындинского отделения  ДВ ж.д. (4-5 человек ежегодно).

В ходе аттестации на квалификационные категории  виден рост квалификационного уровня и педагогического мастерства преподавателя.  Для проведения аттестации распоряжением директора по институту  сформирована аттестационная комиссия, в состав которой входят  17 человек. Председатель аттестационной комиссии –  директор БАмИЖТ, заместитель председателя - заместитель директора по учебной работе, секретарь - методист. Заседания комиссии проводятся планово. Деятельность комиссии регламентируется Законом Российской Федерации «Об образовании», «Положением о порядке аттестации педагогических и руководящих работников государственных и муниципальных образовательных учреждений». (Приказ Министерства образования РФ от 26. 06. 2000 года № 1908). Ежегодно аттестацию на подтверждение квалификационной категории или на более высокую категорию проходят от 13 до 23 человек..

Для активизации учебного процесса преподаватели института  широко используют новые нестандартные формы обучения.  Интегрированные уроки и внеклассные мероприятия, уроки с использованием инновационных форм и методов обучения  - проблемное обучение, уроки  конференции, имитационные игры,  литературная гостиная, тестовый контроль знаний; проблемные семинары, модульно-рейтинговая система, деловые и имитационные игры и использование листов с опорными сигналами (суть метода заключается в том, что студент может представить разделы или пункты инструкции в удобной для его восприятия форме – таблица, схема, рисунок и т.д.); уроки с использованием ПВЭМ и видеотехники. Урок - групповой зачет проводится после изучения любого раздела при помощи обучающей  компьютерной  программы с целью  подтверждения полученных ранее знаний в изменившихся условиях  (компьютер – преподаватель). На уроке в форме деловой   игры   происходит обсуждение  аварийных и нестандартных ситуаций с их детальным анализом.

При планировании учебных занятий преподаватели института ведущую роль отводят управлению самостоятельной работой студентов, а также педагогике сотрудничества. С целью повышения методического мастерства и обмена опытом преподавателей проводятся открытые уроки и организуются взаимопосещения занятий. Анализ посещенных занятий записывается в листы или журналы по цикловым комиссиям. В среднем преподаватели  института за учебный год посещают  по 5-6 занятий, а председатели цикловых комиссий по 10 – 12 занятий.

В БАмИЖТ  внедряются в учебный процесс  технические средства обучения; ряд учебных кабинетов оснащён видео проекционной аппаратурой и мультимедиа.

Уроки,  проводимые на учебных полигонах специальностей подвижного состава,  строительства железных дорог и автоматики и телемеханики, направлены на развитие творческого мышления студентов, они решают вопросы проблемного обучения.    Кроме того, все преподаватели, в той или иной мере, используют на своих  занятиях обучающие и контролирующие компьютерные программы. Для выполнения опережающих заданий студенты нередко используют Интернет, доступ к которому имеется в рамках информационного центра  института.

Преподаватели института практикуют проведение уроков-экскурсий на линейных предприятиях Тындинского отделения ДВ ж.д.  В институте, в учебном процессе, уже не первый год успешно используются реальные компьютерные программы: «АРМ оператора товарной конторы», «АРМ оператора технической конторы по прибытию и отправлению», «ГИД»; «Компас-график». Преподавателями института совместно со студентами специальностей созданы интерактивные учебники по дисциплинам и компьютерные программы, которые используются в учебном процессе.  Большая и систематическая работа ведется преподавателями института   по накоплению различного дидактического материала и созданию учебно-методических комплексов преподаваемых дисциплины.

Для организации самостоятельной работы студентов и привития им интереса к профессиональной деятельности  на факультетах организована кружковая работа по кабинетам и лабораториям. Силами студентов во внеурочное время изготавливаются плакаты, стенды, макеты, модели, тестовые задания, которые затем используются в учебном процессе. Преподаватели и студенты  БАмИЖТ принимают активное участие в подготовке и проведении ежегодных олимпиад  как   внутри учебного заведения, так и областных, где занимают призовые места. 

Большое внимание преподаватели института  уделяют развитию фонда методических разработок в порядке обмена опытом и методических указаний для выполнения курсовых проектов (работ), лабораторных и практических работ, а также указаний по организации самостоятельной работы студентов.

С целью обучения начинающих преподавателей педагогическому мастерству работает  школа начинающего педагога, где рассматриваются способы и средства осуществления профессионально-педагогической деятельности, организуются семинары, посещения уроков у преподавателей высшей категории и взаимопосещения занятий. Посещенные занятия  анализируются и преподавателям даются рекомендации. Все возникающие проблемы вносятся в план работы школы на следующий год.

Перед преподавателями и руководством  института в связи с внедрением информационных и инновационных технологий встают новые задачи. Более широкое развитие технического творчества студентов. Проведение конкурсов мастерства.  Дооснащение кабинетов и лабораторий тренажёрами и макетами,  видео аппаратурой и мультимедийным оборудованием.

Для повышения качества образования в институте поддерживается  постоянная связь с производством, т.к. внедрение новинок в учебный процесс зачастую зависит от линейных предприятий железнодорожного транспорта, а также используются технологии, развивающие практическую и профессиональную направленность студентов.